Le relief du district de Mouyondzi est principalement constitué du plateau Babembé qui a une altitude de 650m. Il est aussi constitué des collines et des vallées encaissées sédimentaires qui donnent des sols schisto-calcaires et très ferralitiques. Notons que les pays de Mouyondzi sont arrosés par plusieurs cours d’eau dont : la Louati, la Louloulou et la Loulo.
Cependant, Le climat de Mouyondzi est Bas-Congolais, caractérisé par quatre saisons nettes et
régulières :
- TOMBO : une petite saison de pluie d’Octobre à Décembre
- MWANGA : une petite saison sèche de Janvier à Février
- NDOLO : une grande saison de pluie de Mars à Juin
- KISIHU : une grande saison sèche de Juillet à Septembre

La végétation est constituée de savane haute, de lambeaux de forêts, des bosquets et
des galeries forestières le long des cours d’eaux